9783319149134 - protein homology detection through alignment of markov random fields: using mrfalign (springerbriefs in computer science) von xu, jinbo (3 Ergebnisse)
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Verlag: Springer 2015
Serie: SpringerBriefs in Computer Science, Buch 170 von 322. Buch 170 von 322 - SpringerBriefs in Computer Science
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Taschenbuch. Zustand: Neu. Druck auf Anfrage Neuware - Printed after ordering - This work covers sequence-based protein homology detection, a fundamental and challenging bioinformatics problem with a variety of real-world applications. The text first surveys a few popular homology detection methods, such as Position-Specific Sco…ring Matrix (PSSM) and Hidden Markov Model (HMM) based methods, and then describes a novel Markov Random Fields (MRF) based method developed by the authors. MRF-based methods are much more sensitive than HMM- and PSSM-based methods for remote homolog detection and fold recognition, as MRFs can model long-range residue-residue interaction. The text also describes the installation, usage and result interpretation of programs implementing the MRF-based method.
