This practical guide shows postdoc bioinformatics professionals and students how to exploit the best parts of Python to solve problems in biology while creating documented, tested, reproducible software.&Uumlber den AutorKen Youens-. Bestandsnummer des Verk�ufers 437479631

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Bibliografische Details

Titel: Reproducible Bioinformatics with Python: How...

Verlag: O'Reilly Media

Erscheinungsdatum: 2021

Einband: Softcover

Zustand: New

�ber diesen Titel

Inhaltsangabe:

Life scientists today urgently need training in bioinformatics skills. Too many bioinformatics programs are poorly written and barely maintained, usually by students and researchers who've never learned basic programming skills. This practical guide shows postdoc bioinformatics professionals and students how to exploit the best parts of Python to solve problems in biology while creating documented, tested, reproducible software.

Ken Youens-Clark, author of Tiny Python Projects (Manning), demonstrates not only how to write effective Python code but also how to use tests to write and refactor scientific programs. You'll learn the latest Python features and tools including linters, formatters, type checkers, and tests to create documented and tested programs. You'll also tackle 14 challenges in Rosalind, a problem-solving platform for learning bioinformatics and programming.

Create command-line Python programs to document and validate parameters
Write tests to verify refactor programs and confirm they're correct
Address bioinformatics ideas using Python data structures and modules such as Biopython
Create reproducible shortcuts and workflows using makefiles
Parse essential bioinformatics file formats such as FASTA and FASTQ
Find patterns of text using regular expressions
Use higher-order functions in Python like filter(), map(), and reduce()

�ber die Autorin bzw. den Autor:

Ken Youens-Clark works as a Data Engineer at The Critical Path Institute where he helps partners in industry, academia, and government find novel drug therapies for diseases ranging from cancer and tuberculosis to thousands of rare diseases. His career in bioinformatics began in 2001 when he joined a plant genomics project at Cold Spring Harbor Laboratory under the direction of Dr. Lincoln Stein, a prominent author of books and modules in Perl and an early advocate for open software, data, and science. In 2014 Ken moved to Tucson, AZ, to work as a Senior Scientific Programmer at the University of Arizona where he completed a MS in Biosystems Engineering in 2019. While at UA, Ken enjoyed teaching programming and bioinformatics skills, and used some of those ideas in his first book, Tiny Python Projects (Manning, 2020), which uses a test-driven development approach to teaching Python.

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Moluna GmbH
Engberdingdamm 27, Greven, 48268, Germany

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(2) Verbraucher im Sinne der nachstehenden Regelungen ist jede nat�rliche Pe...

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Engberdingdamm 27
48268 Greven
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Telefon: 02571/5698933
E-Mail: abe@moluna.de

Alternative Streitbeilegung:
Die Europ�ische Kommission stellt eine Plattform f�r die au�ergerichtliche Online-Streitbeilegung (OS-Plattform) bereit, aufrufbar unter https://ec.europa.eu/odr.

Informationen zum Zustandekommen des Vertrages

Die technischen Schritte zum Vertragsschluss, der Vertragsschluss selbst und die Korrekturm�glichkeiten erfolgen nach Ma�gabe der Regelungen "Zustandekommen des Vertrages" unserer Allgemeinen Gesch�ftsbedingungen (Teil I.).

Vertragssprache, Vertragstextspeicherung

3.1. Vertragssprache ist deutsch .

3.2. Der vollst�ndige Vertragstext wird von uns nicht gespeichert. Vor Absenden der Bestellung k�nnen die Vertragsdaten �ber die Druckfunktion des Browsers ausgedruckt oder elektronisch gesichert werden. Nach Zugang der Bestellung bei uns werden die Bestelldaten, die gesetzlich vorgeschriebenen Informationen bei Fernabsatzvertr�gen und die Allgemeinen Gesch�ftsbedingungen nochmals per E-Mail an Sie �bersandt.

Wesentliche Merkmale der Ware oder Dienstleistung

Die wesentlichen Merkmale der Ware und/oder Dienstleistung finden sich im jeweiligen Angebot.

Preise und Zahlungsmodalit�ten

5.1. Die in den jeweiligen Angeboten angef�hrten Preise sowie die Versandkosten stellen Gesamtpreise dar. Sie beinhalten alle Preisbestandteile einschlie�lich aller anfallenden Steuern.

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5.3. Die Ihnen zur Verf�gung stehenden Zahlungsarten sind unter einer entsprechend bezeichneten Schaltfl�che auf unserer Internetpr�senz oder im jeweiligen Angebot ausgewiesen.

5.4. Soweit bei den einzelnen Zahlungsarten nicht anders angegeben, sind die Zahlungsanspr�che aus dem geschlossenen Vertrag sofort zur Zahlung f�llig.

Lieferbedingungen

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Soweit im jeweiligen Angebot oder unter der entsprechend bezeichneten Schaltfl�che keine andere Frist angegeben ist, erfolgt die Lieferung der Ware innerhalb von 3-5 Tagen nach Vertragsschluss (bei vereinbarter Vorauszahlung jedoch erst nach dem Zeitpunkt Ihrer Zahlungsanweisung).

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