Genome annotation and finding repetitive DNA elements

Sprache: Englisch

Verlag: GRIN Verlag, 2014

3656659818 / 9783656659815

  • Softcover
  • Gebraucht
Alle Details anzeigen

Anbieter: Buchpark, Trebbin, DeutschlandBuchpark

Verkäufer/-in mit 5 Sternen

Verkäufer:in bei ZVAB seit 30. September 2021

Softcover

Zustand: Gebraucht

EUR 14,80

EUR 105,00 Versand 
Versand von Deutschland nach USA

Anzahl: 1 verfügbar

In den Warenkorb
30 Tage kostenlose Rückgabe

Artikelbeschreibung des Verkäufers

Zustand: Hervorragend | Sprache: Englisch | Produktart: Bücher | Bachelor Thesis from the year 2014 in the subject Computer Science - Bioinformatics, grade: 8.26, Lovely Professional University, Punjab, course: b.tech honors biotechnology, language: English, abstract: As the number of genomes sequenced is increasing at high rate, there is a need of gene prediction method which is quick, reliable, inexpensive. In such conditions, the computations tool will serve as an alternative to wet lab methods. The confidence level of annotation by the tool can be enhanced by preparing exhaustive training data sets. The aim is to develop a tool which will read data from a DNA sequence file in the fasta format and will annotate it. For this purpose Genome Database was used to retrieve the input data. PERL programming has been put to develop this tool for annotation. To increase the confidence level of annotation the data was validated from multiple sources. Perl script was written to find the promoter region, repeats, transcription factor binding site, base periodicity, and nucleotide frequency. The program written was also executed to identify repeats, poly (A) signals, CpG islands, ARS. The tool will annotate the DNA by predicting the gene structure based on the consensus sequences of important regulatory elements. The confidence level of annotation of the predicted gene, non-coding region, ARS, repeats etc. were checked by running test dataset. This test dataset was annotated data as reported by genome database and computational tools. Gene prediction of the non-coding regions as reported by genome database (SGD) were performed by existing tools; the regions identified as non-coding by these tools were then analyzed for presence of repeats. The BLAST was used to annotate on the basis of sequence similarity with the already annotated genes. GeneMark.hmm and FGENESH were used for gene prediction. In order to validate the predicted results, annotations of genome of Saccharomyces cerevisiae from SGD Database, and output of different computational tools viz, Emboss-CpGplot, PolyAh, REPFind, Promoter 2.0 Prediction Server were compared with the output of developed tool. The output generated was also used for validation and checking sensitivity of the tool. Such tools reduce the cost and time required for genome annotation and bridge the gap between sequenced and annotated data. The output generated by the developed tool was also used for validation and checking sensitivity of the tool. Such tools reduce the cost and time required for genome annotation and bridge the gap between sequenced and annotated data.…

Bestandsnummer des Verkäufers 24781274/1

Titel
Genome annotation and finding repetitive DNA elements
Autor
Rawat, Renu
Verlag
GRIN Verlag
Erscheinungsjahr
2014
Zustand
Hervorragend
Einband
Softcover
Sprache
Englisch
ISBN-10
3656659818
ISBN-13
9783656659815
Verkäuferkataloge
Bücher

Buchpark

Trebbin, Deutschland

Verkäufer/-in mit 5 Sternen

Verkäufer:in bei ZVAB seit 30. September 2021

Versandkosten von Deutschland nach USA

Artikel60 bis 60 Werktage60 bis 60 Werktage
Erster ArtikelEUR 105,00EUR 130,00
Die Versandzeiten werden von den Verkäuferinnen und Verkäufern festgelegt. Sie variieren je nach Versanddienstleister und Standort. Sendungen, die den Zoll passieren, können Verzögerungen unterliegen. Eventuell anfallende Abgaben oder Gebühren sind von der Käuferin bzw. dem Käufer zu tragen. Die Verkäuferin bzw. der Verkäufer kann Sie bezüglich zusätzlicher Versandkosten kontaktieren, um einen möglichen Anstieg der Versandkosten für Ihre Artikel auszugleichen.

Zahlungsarten

  • Visa
  • Mastercard
  • American Express
  • Carte Bleue
  • Apple Pay
  • Google Pay
  • Banküberweisung
  • PayPal
  • Vorauskasse

Shopbeschreibung

Seit über 30 Jahren handeln wir mit Büchern. Begonnen hat alles als kleiner Fachbuchhandel in Berlin. Heute sind wir spezialisiert auf den An- und Verkauf gebrauchter Bücher. Noch immer liegt unser Fokus dabei auf den Kategorien: Fachbuch und englischsprachige Literatur. Hinzu kommen Bücher aus allen anderen Genres, wie Belletristik, Biografien oder Kinderbücher. Unser oberstes Ziel ist dabei die Weiterverwendung von Dingen und die Schonung von Ressourcen. Neben dem Ankauf von privaten Büchern oder Haushaltsauflösungen kaufen wir bundesweit komplette Bibliotheken und Buchbestände von Institutionen auf, um diese nachhaltig ein weiteres Mal auf den Markt zu bringen. Parallel dazu bietet Buchpark die Möglichkeit, große Mengen einzulagern. Ganze Bibliotheken und umfangreiche Buchbestände werden von uns professionell auf Qualitätsmerkmale hin untersucht und sorgfältig für den Onlinehandel aufbereitet. Wir schenken Büchern ein zweites Leben.…

Unternehmensdaten der Verkäuferin bzw. des Verkäufers

Buchpark GmbH

Krügerweg 1
Trebbin, Deutschland 14959