Ion Mandoiu, PhD, is an associate professor in the Computer Science and Engineering Department at the University of Connecticut, USA. His main research interests are in the design and analysis of approximation algorithms for NP-hard optimization problems, p.

Bestandsnummer des Verk�ufers 556566650

Verk�ufer kontaktieren

Diesen Artikel melden

Bibliografische Details

Titel: Computational Methods for Next Generation Sequencing Data Analysis
Verlag: John Wiley & Sons
Ver�ffentlichungsdatum: 2016
Sprache: Englisch
ISBN-10: 1118169484
ISBN-13: 9781118169483
Bindung: Hardcover
Zustand: New

�ber diesen Titel

Inhaltsangabe

Introduces readers to core algorithmic techniques for next-generation sequencing (NGS) data analysis and discusses a wide range of computational techniques and applications

This book provides an in-depth survey of some of the recent developments in NGS and discusses mathematical and computational challenges in various application areas of NGS technologies. The 18 chapters featured in this book have been authored by bioinformatics experts and represent the latest work in leading labs actively contributing to the fast-growing field of NGS. The book is divided into four parts:

Part I focuses on computing and experimental infrastructure for NGS analysis, including chapters on cloud computing, modular pipelines for metabolic pathway reconstruction, pooling strategies for massive viral sequencing, and high-fidelity sequencing protocols.

Part II concentrates on analysis of DNA sequencing data, covering the classic scaffolding problem, detection of genomic variants, including insertions and deletions, and analysis of DNA methylation sequencing data.

Part III is devoted to analysis of RNA-seq data. This part discusses algorithms and compares software tools for transcriptome assembly along with methods for detection of alternative splicing and tools for transcriptome quantification and differential expression analysis.

Part IV explores computational tools for NGS applications in microbiomics, including a discussion on error correction of NGS reads from viral populations, methods for viral quasispecies reconstruction, and a survey of state-of-the-art methods and future trends in microbiome analysis.

Computational Methods for Next Generation Sequencing Data Analysis:

Reviews computational techniques such as new combinatorial optimization methods, data structures, high performance computing, machine learning, and inference algorithms
Discusses the mathematical and computational challenges in NGS technologies
Covers NGS error correction, de novo genome transcriptome assembly, variant detection from NGS reads, and more

This text is a reference for biomedical professionals interested in expanding their knowledge of computational techniques for NGS data analysis. The book is also useful for graduate and post-graduate students in bioinformatics.

�ber die Autorin bzw. den Autor

Ion Mandoiu, PhD, is an associate professor in the Computer Science and Engineering Department at the University of Connecticut, USA. His main research interests are in the design and analysis of approximation algorithms for NP-hard optimization problems, particularly in the area of bioinformatics. Dr. Mandoiu has authored over 100 refereed articles in journals and conference proceedings. He has also co-edited (with A. Zelikovsky) a book on Bioinformatics Algorithms: Techniques and Applications (Wiley 2008).

Alexander Zelikovsky, PhD, is a Distinguished University Professor with the Computer Science Department at the Georgia State University, USA. His research focuses on discrete algorithms and their applications in computational biotechnology and biology, bioinformatics, VLSI CAD, and wireless networks. Dr. Zelikovsky has authored more than 170 refereed publications. He served as the co-Chair of International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (2005-2016) and the Workshop on Computational Advances in Next-Generation Sequencing (2011-2015).

��ber diesen Titel� kann sich auf eine andere Ausgabe dieses Titels beziehen.

Anbieterinformationen

Online Handel nur mit Neub�chern

Zur Homepage des Verk�ufers

Unternehmensdaten des Verk�ufers

Moluna GmbH
Engberdingdamm 27, Greven, 48268, Germany

Gesch�ftsbedingungen und Versandinformationen

Verkaufsbedingungen

Allgemeine Gesch�ftsbedingungen und Kundeninformationen/Datenschutzerkl�rung

I. Allgemeine Gesch�ftsbedingungen

� 1 Grundlegende Bestimmungen

(1) Die nachstehenden Gesch�ftsbedingungen gelten f�r Vertr�ge, die Sie mit uns als Anbieter (Moluna GmbH) �ber die Internetplattformen AbeBooks schlie�en. Soweit nicht anders vereinbart, wird der Einbeziehung gegebenenfalls von Ihnen verwendeter eigener Bedingungen widersprochen.

(2) Verbraucher im Sinne der nachstehenden Regelungen ist jede nat�rliche Pe...

Mehr Information

Versandbedingungen

II. Kundeninformationen

Identit�t des Verk�ufers

Moluna GmbH
Engberdingdamm 27
48268 Greven
Deutschland
Telefon: 02571/5698933
E-Mail: abe@moluna.de

Alternative Streitbeilegung:
Die Europ�ische Kommission stellt eine Plattform f�r die au�ergerichtliche Online-Streitbeilegung (OS-Plattform) bereit, aufrufbar unter https://ec.europa.eu/odr.

Informationen zum Zustandekommen des Vertrages

Die technischen Schritte zum Vertragsschluss, der Vertragsschluss selbst und die Korrekturm�glichkeiten erfolgen nach Ma�gabe der Regelungen "Zustandekommen des Vertrages" unserer Allgemeinen Gesch�ftsbedingungen (Teil I.).

Vertragssprache, Vertragstextspeicherung

3.1. Vertragssprache ist deutsch .

3.2. Der vollst�ndige Vertragstext wird von uns nicht gespeichert. Vor Absenden der Bestellung k�nnen die Vertragsdaten �ber die Druckfunktion des Browsers ausgedruckt oder elektronisch gesichert werden. Nach Zugang der Bestellung bei uns werden die Bestelldaten, die gesetzlich vorgeschriebenen Informationen bei Fernabsatzvertr�gen und die Allgemeinen Gesch�ftsbedingungen nochmals per E-Mail an Sie �bersandt.

Wesentliche Merkmale der Ware oder Dienstleistung

Die wesentlichen Merkmale der Ware und/oder Dienstleistung finden sich im jeweiligen Angebot.

Preise und Zahlungsmodalit�ten

5.1. Die in den jeweiligen Angeboten angef�hrten Preise sowie die Versandkosten stellen Gesamtpreise dar. Sie beinhalten alle Preisbestandteile einschlie�lich aller anfallenden Steuern.

5.2. Die anfallenden Versandkosten sind nicht im Kaufpreis enthalten. Sie sind �ber eine entsprechend bezeichnete Schaltfl�che auf unserer Internetpr�senz oder im jeweiligen Angebot aufrufbar, werden im Laufe des Bestellvorganges gesondert ausgewiesen und sind von Ihnen zus�tzlich zu tragen, soweit nicht die versandkostenfreie Lieferung zugesagt ist.

5.3. Die Ihnen zur Verf�gung stehenden Zahlungsarten sind unter einer entsprechend bezeichneten Schaltfl�che auf unserer Internetpr�senz oder im jeweiligen Angebot ausgewiesen.

5.4. Soweit bei den einzelnen Zahlungsarten nicht anders angegeben, sind die Zahlungsanspr�che aus dem geschlossenen Vertrag sofort zur Zahlung f�llig.

Lieferbedingungen

6.1. Die Lieferbedingungen, der Liefertermin sowie gegebenenfalls bestehende Lieferbeschr�nkungen finden sich unter einer entsprechend bezeichneten Schaltfl�che auf unserer Internetpr�senz oder im jeweiligen Angebot.

Soweit im jeweiligen Angebot oder unter der entsprechend bezeichneten Schaltfl�che keine andere Frist angegeben ist, erfolgt die Lieferung der Ware innerhalb von 3-5 Tagen nach Vertragsschluss (bei vereinbarter Vorauszahlung jedoch erst nach dem Zeitpunkt Ihrer Zahlungsanweisung).

6.2. Soweit Sie Verbraucher sind ist gesetzlich geregelt, dass die Gefahr des zuf�lligen Untergangs und der zuf�lligen Verschlechterung der verkauften Sache w�hrend der Versendung erst mit der �bergabe der Ware an Sie �bergeht, unabh�ngig davon, ob die Versendung versichert oder unversichert erfolgt. Dies gilt nicht, wenn Sie eigenst�ndig ein nicht vom Unternehmer benanntes Transportunternehmen oder eine sonst zur Ausf�hrung der Versendung bestimmte Person beauftragt haben.

Sind Sie Unternehmer, erfolgt die Lieferung und Versendung auf Ihre Gefahr.